Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Camsap2Q8C1B1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Camsap2Q8C1B1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms