Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Nek11Q8C0Q4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Nek11Q8C0Q4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Nek11Q8C0Q4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Nek11Q8C0Q4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Nek11Q8C0Q4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Nek11Q8C0Q4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Nek11Q8C0Q4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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