Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek11Q8C0Q4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms