Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms