Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms