Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms