Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap20Q8BTU1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms