Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdhaf3Q8BQU3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdhaf3Q8BQU3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms