Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cgrrf1Q8BMJ7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms