Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms