Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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