Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms