Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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