Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TnnQ80Z71 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TnnQ80Z71 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms