Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms