Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh8Q80Y20 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh8Q80Y20 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms