Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm2Q80W85 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms