Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rusc2Q80U22 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rusc2Q80U22 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms