Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NischQ80TM9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
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