Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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