Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms