Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf653Q6YND2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf653Q6YND2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms