Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc44a1Q6X893 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms