Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rhox8Q6VSS7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms