Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms