Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms