Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms