Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms