Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbtb40Q6PCS8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms