Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtminQ6P9S1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms