Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smchd1Q6P5D8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms