Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms