Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SphkapQ6NSW3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms