Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc66Q6NS45 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms