Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mvb12bQ6KAU4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms