Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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