Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms