Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CltbQ6IRU5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms