Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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