Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms