Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo27Q6DIA9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms