Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nop58Q6DFW4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms