Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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