Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms