Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms