Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms