Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt12Q64291 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms