Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Defa17Q64016 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Defa17Q64016 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Defa17Q64016 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Defa17Q64016 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Defa17Q64016 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Defa17Q64016 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa17Q64016 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms