Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift52Q62559 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ift52Q62559 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms