Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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