Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf6Q62311 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf6Q62311 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms